Segundo periodo madrileño (febrero de 1797 - agosto de 1797)

En Madrid Betancourt muestra en la Academia de San Fernando algunas novedades como las nuevas formas de grabado aprendidas por Sureda, que luego, aprendidas de éste, utilizará Goya.

Matrimonio canónico de Betancourt con Ana Jourdain en Madrid.

Después de trasladar los instrumentos, conseguir los pasaportes y embarcar en La Coruña en el bergantín Infante con destino a Cuba, Betancourt, sus acompañantes y toda la tripulación son apresados por la fragata inglesa Boston el 9 de junio, un día después de salir del puerto. Los ingleses se incautan de los instrumentos y la biblioteca científica reunida por Betancourt y unos días después se libera a los pasajeros en Lisboa.

Godoy encarga a Betancourt reponer el cargamento perdido y Betancourt se ofrece voluntario para ir a París a reunirlo de nuevo. Después de varias compensaciones económicas dadas a éste por los percances del asalto inglés, viaja a París.